Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms