Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATPIF1Q9UII2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms