Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms