Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNAL1Q9UBT7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms