Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPG2Q9UBF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms