Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC59Q9P031 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms