Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms