Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms