Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTG2Q9NY99 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms