Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms