Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms