Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHPT1Q9NRX4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHPT1Q9NRX4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms