Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms