Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM7Q9NR12 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms