Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CNGB3Q9NQW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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CNGB3Q9NQW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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