Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms