Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms