Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAJC4Q9NNZ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJC4Q9NNZ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms