Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms