Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms