Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDEM3Q9BZQ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms