Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF3BQ9BZI7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms