Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTDSS2Q9BVG9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS2Q9BVG9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms