Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAGR1Q9BTK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms