Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
THUMPD2Q9BTF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms