Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C16orf70Q9BSU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C16orf70Q9BSU1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms