Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms