Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UHRF1Q96T88 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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