Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms