Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN4Q96Q06 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLIN4Q96Q06 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms