Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR78Q96P69 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms