Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF4Q96M43 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF4Q96M43 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF4Q96M43 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF4Q96M43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms