Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms