Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT74Q96LB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT74Q96LB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms