Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms