Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms