Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYFIP2Q96F07 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms