Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM5Q96DZ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms