Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC11Q96DB2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC11Q96DB2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms