Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBGCP3Q96CW5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms