Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms