Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms