Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF31Q8WWY3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF31Q8WWY3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms