Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf54Q8WWF1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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