Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms