Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD1Q8NHV4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms