Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms