Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMG8Q8ND04 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms