Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC63Q8NA47 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms