Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN19Q8N6F1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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